Mitusada inimelu nõudnud ja tuhandeid maju hävitanud Kubani üleujutuse tegelikud põhjused pole teada. Selle skoori kohta on aga mitmeid teooriaid, nii ametlikke kui ka "populaarseid".
Ööl vastu 7. juulit algas Kubanis üleujutus, mis hävitas majad Gelendzhikus, Novorossiyskis, Krymskis ja paljudes külades. Sel hetkel, kui ilmnes esimene eriolukordade ministeeriumi hoiatus, istusid ellujäänud juba majakatustel ning eakad, lapsed ja puuetega inimesed, kes ei pääsenud, tapeti. Just see asjaolu võimaldab meil väita, et sadade inimeste surmas on osaliselt süüdi eriolukordade ministeeriumi esindajad, kes ei hoiatanud katastroofi eest õigeaegselt ega korraldanud evakuatsiooni.
Väidetavalt on liiga suur sademete hulk üleujutuste põhjustaja. Ametlike avalduste kohaselt tabas Kubanit päeva jooksul viiekuune sademete hulk, mis põhjustas jõgede ülevoolu ja linnade uputamist. Eriti raskelt kannatas Krymsk, kus veetase ületas mõnes kohas kolme meetri piiri. Oja oli nii tugev, et veesurve tagurdasid sõiduautod ja isegi veoautod.
Mitteametlik versioon, mille ametnikud tagasi lükkavad, on Neberdzhaevsky veehoidla läbimurre või sellest organiseeritud või automaatne vee väljajuhtimine. Eelkõige õnnestus uurimiskomisjoni esindajatel kindlaks teha, et veevesi veehoidlast voolas tugeva vihma tekkimisel tõepoolest välja, kuid pole võimalik kindlalt öelda, mis see täpselt tragöödiani viis. Samuti levivad kuulujutud, et äravool ei olnud automaatne, vaid spetsiaalselt korraldatud, kuna ametnikel oli valida: kas Krymsk üle ujutada või lasta vett läbi Kubani teiste osade, sealhulgas ala, kus asub president Putini dacha. Seda versiooni pole ei kinnitatud ega ümber lükatud.
Ja lõpuks ütleb ametlik teooria, et üleujutus Kubanis oli tingitud üleujutustele kalduvate alade arengust. Et tragöödia ei korduks tulevikus, tehti Gosprirodnadzorile, Rosvodresursile ja Roshydrometile ülesandeks võtta kõik vajalikud meetmed. Hüdroloogilised postid otsustati võimalikult kiiresti taastada, tagada Krymski ja Novorossiyski meteoroloogiajaamade parim toimimine ning võtta meetmeid uute loodusõnnetuste ennetamiseks.