Keskajal oli vabamüürlaste kord väga laialt levinud, see koosnes 17. sajandil ühiskonda juhtinud kõige arenenumatest mõtetest: Buckle, Bacon, Leibniz, Jan Comenius, kuningliku verega isikud. Nende avalduste järgi on masonite eesmärk kanda ja säilitada vaimseid hüvesid kogu inimkonnale. Täna hõlmab see tellimus ka tuhandeid inimesi. Selle kogukonna tunnuseks olid kuulsad vabamüürlaste saladused.
Muutus vabamüürlaste põhikirjas toimus 1717. aastal, kui vabamüürlus muutus "spekulatiivseks" (või "filosoofiliseks"). Kõigil vennaskonna liikmetel kästi teatud sõnu, märke ja käepigistusi saladuses hoida, nad pidid neid austama ja hoiduma nende avalikust näitamisest. Aja jooksul sai müsteeriumist kultuse lahutamatu osa ja vaatamata paljude saladuste avaldamisele 1730. aastal ei peatunud vabamüürlased oma põhikirja austamist.
Vabamüürlaste üks peamisi saladusi oli ebaharilik ja väga keeruline tseremoonia uute liikmete vastuvõtmiseks seltskonda (looži). Silmadeta toodi "võhik" kindlasse kohta, kuhu ülejäänud öömaja liikmed olid juba kogunenud. Astudes kirjutatud märkidele (nende tähendus paljastus alles pärast tellimusega liitumist), loeb ta pidulikult vande teksti. Reetmise või saladuse avalikustamise korral reedab ta vendade mõõgalt oma hinge igavese hukkamõistu ja keha surnuks. Uuele liikmele omistatakse valge nahast põll, müürseppade vendade sümbol, meeste labakindad ja hõbedane spaatliga - nüüdsest kutsutakse teda üles ehitama inimkonna suurt templit.
Tseremoonia võis erinevate öömajade puhul olla veidi erinev - vastuvõetud liikmetele edastati salajasi märke, salajasi sõnu, kujukesi, nad said tätoveeringud, mille järgi teised masonid nad ära tundsid. Veel salajasem ja vähetuntud oli kõrgematesse astmetesse initsiatsiooni tseremoonia - üldiselt oli vabamüürluse hierarhilises redelis 33 astet.
Vabamüürlaste korra põhimõte põhineb saladusel. Kaasaegne vabamüürlus peab end piisavalt tugevaks, seetõttu ei näe vandenõu vajadust, kuid üldine teadlikkus ei saa hõlmata salajast tööd, varjatud vabamüürlust. Lubades loožiga liitumise tseremoonial vaikida, on looži liige edaspidi kohustatud täitma kõik kõrgemate liikmete korraldused.
Õpilasel pole aimugi sõbra tööst, kes omakorda ei tea midagi meistri eesmärkidest ja tööst. Jüngrid tunnevad vaid mõnda looži liiget, ülejäänud pole neile teada. Samamoodi tunneb meister oma otsest ülemust ja ülejäänud ei tea (ehkki nad elavad võib-olla tema kõrval). Selline salajase ühiskonna süsteem töötab kõigil hierarhia tasanditel. Ülevalt antud korraldus täidetakse kaudselt ja salaja.
Madalamatel astmetel asuvad vabamüürlased täidavad ainult täitjate rolli. Peamised saladused on peidetud püramiidi tippu - neid teavad ainult vabamüürlaste looži adeptid ja vürstid. Ainult nemad määravad ordeni tegelikud eesmärgid - ja valitsevad kõiki teisi. Püha teadmine oli teiste eest nii hoolikalt varjatud, et paljusid möödunud sajandite saladusi pole tänapäeval enam võimalik õppida.